Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmc2Q8K199 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmc2Q8K199 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmc2Q8K199 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmc2Q8K199 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmc2Q8K199 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmc2Q8K199 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmc2Q8K199 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmc2Q8K199 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmc2Q8K199 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmc2Q8K199 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmc2Q8K199 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmc2Q8K199 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmc2Q8K199 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmc2Q8K199 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmc2Q8K199 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms