Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c1Q8K193 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms