Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS7

Hmgcll1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgcll1Q8JZS7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hmgcll1Q8JZS7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hmgcll1Q8JZS7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hmgcll1Q8JZS7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hmgcll1Q8JZS7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms