Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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