Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mterf1aQ8CHZ9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms