Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
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Atg4aQ8C9S8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Atg4aQ8C9S8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Atg4aQ8C9S8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Atg4aQ8C9S8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Atg4aQ8C9S8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Atg4aQ8C9S8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Atg4aQ8C9S8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Atg4aQ8C9S8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Atg4aQ8C9S8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Atg4aQ8C9S8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Atg4aQ8C9S8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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