Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8C5C9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8C5C9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms