Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp5Q8BX09 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp5Q8BX09 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp5Q8BX09 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp5Q8BX09 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp5Q8BX09 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp5Q8BX09 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp5Q8BX09 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp5Q8BX09 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp5Q8BX09 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp5Q8BX09 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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