Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim6Q8BGE7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim6Q8BGE7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim6Q8BGE7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim6Q8BGE7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim6Q8BGE7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim6Q8BGE7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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