Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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NanogQ80Z64 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NanogQ80Z64 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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