Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Zbed4Q80WQ9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Zbed4Q80WQ9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Zbed4Q80WQ9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Zbed4Q80WQ9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed4Q80WQ9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms