Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Clec18aQ7TSQ1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Clec18aQ7TSQ1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Clec18aQ7TSQ1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Clec18aQ7TSQ1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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