Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ckap2lQ7TS74 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms