Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt39Q6IFX4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt39Q6IFX4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms