Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt42Q6IFX2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms