Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Atg9aQ68FE2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Atg9aQ68FE2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Atg9aQ68FE2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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