Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Sbno1Q689Z5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Sbno1Q689Z5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sbno1Q689Z5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sbno1Q689Z5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sbno1Q689Z5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Sbno1Q689Z5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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Sbno1Q689Z5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sbno1Q689Z5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sbno1Q689Z5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sbno1Q689Z5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sbno1Q689Z5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sbno1Q689Z5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sbno1Q689Z5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sbno1Q689Z5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sbno1Q689Z5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sbno1Q689Z5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sbno1Q689Z5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sbno1Q689Z5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sbno1Q689Z5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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