Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprdQ64487 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PtprdQ64487 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprdQ64487 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PtprdQ64487 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprdQ64487 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprdQ64487 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprdQ64487 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PtprdQ64487 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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PtprdQ64487 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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