Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms