Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cd6Q61003 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cd6Q61003 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cd6Q61003 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cd6Q61003 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cd6Q61003 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cd6Q61003 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cd6Q61003 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cd6Q61003 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd6Q61003 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cd6Q61003 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cd6Q61003 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cd6Q61003 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cd6Q61003 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cd6Q61003 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cd6Q61003 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cd6Q61003 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cd6Q61003 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cd6Q61003 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cd6Q61003 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cd6Q61003 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cd6Q61003 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cd6Q61003 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cd6Q61003 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cd6Q61003 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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