Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CttnQ60598 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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