Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms