Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ckap2Q3V1H1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms