Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam171bQ14CH0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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