Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms