Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hoxc4Q08624 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hoxc4Q08624 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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