Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms