Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms