Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Flt3Q00342 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms