Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp10Q000W5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gbp10Q000W5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms