Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms