Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnikP83510 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnikP83510 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnikP83510 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TnikP83510 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TnikP83510 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TnikP83510 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnikP83510 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms