Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NficP70255 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NficP70255 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NficP70255 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NficP70255 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NficP70255 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms