Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Crip1P63254 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Crip1P63254 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms