Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms