Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarf2P59222 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarf2P59222 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scarf2P59222 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms