Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm2P58774 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms