Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms