Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NcanP55066 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NcanP55066 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NcanP55066 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NcanP55066 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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