Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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