Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms