Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb42P49222 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms