Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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