Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp3P28862 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp3P28862 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp3P28862 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms