Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms