Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18528 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18528 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18528 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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