Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Tnp1P10856 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms