Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ifna9P09235 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms