Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TtrP07309 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TtrP07309 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms