Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnk2O54967 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnk2O54967 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms